El SN95 experimentó una enorme renovación de diseño en 1999, cuando adoptó el lenguaje de diseño New Edge de Ford. El periodista independiente William Diem, que cubrió el nuevo movimiento de diseño de Ford para Los New York Times en 1998, describió esta nueva apariencia como «una combinación de líneas rectas, curvas y planos». En el Mustang, esto se tradujo en líneas más definidas, ángulos y bordes más nítidos, lo que hizo que el automóvil fuera agresivo y más malo pero atractivo y moderno.
Si bien el interior no cambió mucho, el exterior del New Edge Mustang experimentó cambios peculiares, como su nuevo capó, que se podía ver con o sin tomas de aire. Los faros también se renovaron y quedaron en un conjunto de una sola pieza. A lo largo de los lados, las líneas nítidas y una entrada lateral falsa hacían eco del estilo frontal agresivo, un guiño al diseño de los modelos más antiguos de cuarta generación. La parte trasera también experimentó un cambio de imagen significativo, pasando de un parachoques redondeado a uno más cuadrado y actualizando las luces traseras al icónico diseño rectangular vertical de tres barras.
Ford reservó las luces antiniebla en la parrilla exclusivamente para modelos distintos al V6, y eso no cambió para el New Edge. Sin embargo, para celebrar el 35.º aniversario del Mustang, tanto el V6 como el GT Mustang fueron adornados con una insignia conmemorativa del 35.º aniversario en el guardabarros, marcando un hito importante en la historia del Mustang.