Profluent, una empresa con sede en California inteligencia artificial (AI), la primera empresa de diseño de proteínas, anunció el martes su modelo de IA que puede generar proteínas similares a CRISPR que no se encuentran en la naturaleza. CRISPR o repeticiones palindrómicas cortas agrupadas regularmente interespaciadas es un complejo que contiene proteínas importantes que los científicos pueden utilizar para la edición genética precisa en organismos. La compañía afirma que el uso de IA puede crear una gran cantidad de proteínas que pueden ayudar a crear curas personalizadas para enfermedades que, en la actualidad, siguen siendo incurables.
Ali Madani, fundador y director ejecutivo de Profluent, anunció el modelo de IA en una serie de publicaciones en X (anteriormente conocido como Twitter). La empresa también ha realizado un entrada en el blog detallando la iniciativa y una versión preimpresa de su investigación papel ha sido publicado en bioRxiv. Además de anunciar el modelo de IA que genera el editor de ADN, la compañía también lanzó OpenCRISPR-1, uno de los editores de genes creados por IA, como una versión inicial de código abierto que lo licencia tanto para investigación ética como para usos comerciales.
Por qué es importante el modelo de IA OpenCRISPR
Si bien CRISPR es un foco importante para los científicos, la investigación es limitada debido a que la proteína Cas9, que actúa como editor de genes, y su equivalente solo está disponible en la naturaleza. Como resultado, los científicos dedican una gran cantidad de tiempo a descubrir diferentes tipos de editores de genes y su impacto. Profluent afirma que su modelo de IA, que funciona con un modelo de lenguaje grande (LLM) interno entrenado en “secuencia a gran escala y contexto biológico”, ahora puede generar millones de proteínas diversas similares a CRISPR que no se encuentran en la naturaleza. En teoría, estos editores de genes sintéticos pueden desempeñar un papel fundamental en la búsqueda de curas para enfermedades que antes se consideraban incurables.
En su publicación de blog, la compañía dijo: «El editor de genes OpenCRISPR-1 mantiene la arquitectura prototípica de una nucleasa Cas9 tipo II, pero está a más de 400 mutaciones de SpCas9 y a casi 200 mutaciones de cualquier otra proteína natural conocida asociada a CRISPR».
¿Qué es CRISPR?
CRISPR, en pocas palabras, es un complejo o sistema que se encuentra en bacterias y algunos otros organismos unicelulares. Este complejo contiene proteínas Cas9 (o proteínas similares como Cas12 y Cas13) que tienen una capacidad específica para realizar cortes precisos en cadenas genéticas de ADN para permitir la edición. Fue descubierto por primera vez en 1987 y desde entonces los científicos lo han estado investigando exhaustivamente. La tecnología tiene amplias aplicaciones y ya se ha utilizado para crear artificialmente variantes de cultivos que tienen un mayor rendimiento, son resistentes a las enfermedades y tolerantes a la sequía.
También se utiliza para cambiar el ADN de los mosquitos para que no puedan transmitir enfermedades como la malaria. Se están realizando experimentos para curar a pacientes que padecen enfermedades como la anemia falciforme. También se teoriza que la tecnología se puede utilizar para editar el ADN del embrión para crear bebés que sean naturalmente resistentes a las enfermedades y posean genes que promuevan mayores capacidades físicas y mentales.