Para algunos entusiastas de Jeep, la designación de modelo JK utilizada para el Wrangler de tercera generación fabricado entre 2007 y 2017 significa «es broma». Eso no quiere decir que el Wrangler de tercera generación fuera una completa broma, pero tenía problemas que no se habían visto en las dos generaciones anteriores. El nuevo sistema superior modular ‘Freedom panel’ del JK era propenso a sufrir fugas donde se unían las puertas delanteras y los paneles superiores. No había burletes de goma en el costado de la carrocería alrededor de las aberturas de las puertas, por lo que se abrieron espacios encima y alrededor de las puertas cuando los paneles del techo se desalinearon debido a la vibración.
La era JK también vio el final de la línea para El legendario motor de seis cilindros en línea de 4.0 litros de Jeep. Este motor ocupó el octavo lugar en la lista de SlashGear de los seis en línea más confiables de la industria automotriz y fue reemplazado en 2007 por un V6 de 3.8 litros que no goza de una reputación tan favorable como el 4.0. El par máximo del 3.8 también se produjo en un rango de rpm más alto, lo que lo hace menos adecuado para uso todoterreno. Tendencia del motor cita varios problemas de diseño con el V6 de 3,8 litros, incluido el consumo excesivo de aceite, un colector de escape propenso a agrietarse y anillos de pistón de calidad inferior. Estos problemas a menudo limitaban la vida útil del motor JK a aproximadamente 100,000 millas, que es aproximadamente el punto en el que el 4.0 recién estaba comenzando a funcionar.
El modelo 2017 fue objeto de cinco retiradas del mercado distintas, y el NHTSA registró casi 250 quejas de propietarios, incluidos problemas con el motor, la dirección y los cinturones de seguridad.